投标保函：是投标人向招标人递交投标书时，必须随附银行的投标保函。开标后，中标的投标人先前附来的银行投标保函立即生效。如果投标人在投标有效期内撤回投标，或中标后不与招标人订立合同或不提供履约保函等，银行将根据招标人的索赔要求，按照保函约定的金额向招标人支付赔偿金。
预付款保函：又称还款保函，是指担保人（银行）根据申请人（合同中的预收款人，通常情况下是出口商）的要求向受益人（合同中的预付款人，通常是进口商）开立的，保证一旦申请人未能履约，或者未能全部履约，将在收到受益人提出的索赔后向其返还该预付款的书面保证承诺。
从合同履行角度看
预付款使用期限只是预付款在合同中规定的用于特定事项的时间范围，但合同的履行可能存在后续的验收、质保等多个阶段。例如在工程建设项目中，预付款可能在工程前期用于施工准备等工作，但工程竣工后还有验收环节，如果发现质量问题需要整改，而申请人拒绝承担责任，此时受益人可能需要动用预付款保函来保障自身权益，这种情况下预付款保函期限超过预付款使用期限是合理且必要的，以确保合同的履行。
从法律规定角度看
只要预付款保函期限的约定是在法律法规允许的范围内，且是合同双方真实意思的表示，不存在欺诈、胁迫等违法违规情形，那么保函期限超过预付款使用期限是合法有效的，受到法律的保护。我国《民法典》等相关法律法规尊重当事人的意思自治，允许合同双方根据实际情况协商确定保函期限等条款。